全基因組BISULFITE甲基化測序

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全基因組DNA甲基化測序

全基因組DNA甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測序平臺相結合,對有參考基因組的物種在全基因組水平進行高精準甲基化研究。WGBS可以達到單堿基分辨率,精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態,從而構建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。

 

生物信息分析:

WGBS 分析內容 解決問題
標準分析 測序數據質量評估 過濾掉低質量數據,保證數據質量
與參考基因組比對 比對率和覆蓋度分析
甲基化位點calling 分析甲基化位點
甲基化分布 甲基化在基因組,染色體,功能元件上的分布
差異甲基化分析 尋找DMR
相關基因分析 相關基因GO,KEGG富集分析
多樣本分析 PCA分析多樣本甲基化變化規律
 
 
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