單細胞DNA測序

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單細胞DNA測序

單細胞測序通過對單個細胞進行基因組擴增和測序,解決了用組織樣本無法獲得不同單個細胞的異質性信息、樣本量太少無法進行常規測序的難題,為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向,為早期檢測、診斷疾病及疾病的個體化治療提供指導。

生物信息分析:

單細胞測序可針對性揭示單個細胞整體水平的基因信息,解決了細胞異質性難題。可最真實的獲得單克隆細胞的具體突變來源及精準的突變頻率,用來研究疾病以及癌癥發生發展機制等。

Single cell 全基因組/外顯子組測序

 

癌癥基因組學

疾病基因組學

標準信息分析A

標準信息分析A+

標準信息分析Pro

去除接頭污染序列及低質量數
據比對,產出數據統計SNP 
測、注釋和統計InDel檢測、注 
釋和統計CNV檢測、注釋和統 
計(僅全基因組測序)SV 
測、注釋和統計(僅全基因組 
測序)

1. 數據質控:去除接頭污染和
低質量數據 
2.
與參考序列進行比對、統計
測序深度及覆蓋度 
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV
檢測、注釋及統計(腫瘤成對樣本)

1. 數據質控:去除接頭污染和低質量
數據 
2.
與參考序列進行比對、統計測序深度及覆蓋度 
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV
檢測、注釋及統計(腫瘤成對樣本) 
4.
單細胞Germline SNP聚類分析
5. PAC(主成分)分析
6. Heatmap展示圖(somatic
SNV
 
7.
高頻突變分析(>2對樣本)
  7.1高頻突變基因統計 
  7.2
高頻突變基因富集分析 
8. NMF
突變特征/突變頻譜分析
  8.1突變頻譜分析 
  8.2NMF
突變特征分析(>2對樣本) 
9. NovoDriver
已知驅動基因篩選
10. 基因組變異Circos圖展示

1. 樣本間協同性分析(腫瘤單細胞樣本數量≥2,且必須有組織樣本) 
2. MRT
高頻突變基因相關性分析(>2對樣本) 
  2.1
高頻突變基因協同作用分析 
  2.2
高頻突變基因互斥作用分析 
3. OncodriveCLUST
驅動基因預測
(>2對樣本) 
4.
突變位點分布情況分析
  4.1高頻突變基因SNV/InDel突變 
位點展示 
  4.2
預測驅動基因SNV/InDel突變 
位點展示 
5.
高頻CNV分析
  5.1 CNV分布分析
  5.2 CNV重現性分析(>2對樣
本) 
6.
雜合性缺失(LOH)分析
7. LOF蛋白功能缺失分析
8. NovoDrug高頻突變基因靶向用藥
預測 
9. NovoDR
耐藥突變篩選
10. NovoNoncoding非編碼區高頻
突變分析(單細胞外顯子測序僅不包 
括此分析)

* 定制化信息分析,可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容

 

           

 

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