circRNA

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 circRNA測序
環狀RNA(circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子,與傳統的線性RNA(linear RNA)不同,circRNA分子合呈封閉環狀結構,且不受RNA外切酶影響,表達更穩定,不易降解。環狀RNA測序能夠進行環狀RNA的鑒定以及環狀RNA與miRNA海綿效應分析, 可實現ceRNA(源競爭RNA)機制等研究。
技術優勢
方法靈活:可以使用去核糖體建庫測序數據分析環狀RNA;
結果可靠:采用多種軟件對環狀RNA進行鑒定和預測;
實驗嚴謹:R酶建庫方法穩定,去除線性RNA效率高;
分析經驗豐富:完成了數千份數據的分析。
產品應用



信息分析內容
一、標準信息分析
      1. 基本數據統計
        1.1去除接頭序列、低質量序列得到clean data
        1.2與核糖體數據庫比對,去除核糖體RNA數據
      2. 環狀RNA預測鑒定
      3. 環狀RNA所在線性基因注釋
      4. 環狀RNA在基因組上的定位
      5. 環狀RNA表達定量分析
      6. 樣品(組)間表達差異分析
二、高級信息分析
      1. 差異環狀RNA來源的基因GO功能及富集分析
      2. 差異環狀RNA來源的基因Pathway功能及富集分析
      3. 環狀RNA與miRNA互作分析(適用于人/小鼠物種)
 
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