三代轉錄組測序

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 三代轉錄組測序
       由于二代測序平臺的轉錄組讀長的相對較短,數據組裝的過程中存在較多的嵌合體,不能準確的得到完整轉錄本的信息。因此對后續的表達量分析、可變剪接、基因融合等分析造成了較大的影響。而PacBio的單分子實時測序技術,平均讀長達到10K以上,最長可達40Kb,這樣的長度已經超過了轉錄組中典型的基因的長度,所以基于第三代測序平臺的轉錄組的研究,可以直接得到全長轉錄本信息,而無需組裝,從而最大限度的保證了轉錄組測序結果的準確性。
產品優勢
策略多樣:除常規的全長轉錄組文庫外,還可根據需求增建5-10K大片段文庫,滿足客戶對長轉錄本的研究需求。
樣品起始量低:全長轉錄組樣本需求僅1ug,遠低于同行樣本量需求。
信息分析內容全面:實時跟進科學研究前沿,不斷升級信息分析內容。
個性化分析:具有豐富個性化分析經驗,可根據項目需要選擇最適宜的分析軟件,只為保障最精準結果。
無需組裝:長讀長不需要組裝,就可以準確的得到全長轉錄本的序列信息。
精準基因集:借助三代讀長的優勢獲得更精準基因集,可以改善基因表達定量的結果。
更多新發現:可以發現新的基因和轉錄異構體,并準確的鑒定可變剪接及基因融合現象。
輔助基因注釋:可輔助基因組de novo基因注釋,獲得更好的基因注釋結果。
經驗豐富:已完成100+個全長轉錄組數據分析,信息分析人員問題處理經驗豐富。
研究內容
       一、無參考序列物種
標準信息分析:
1. 數據質控、轉錄本分類
2. 轉錄本聚類與校正
3. 七大轉錄本數據庫注釋
4. 作為參考序列、定量分析
5. lncRNA預測
6. 編碼蛋白框預測
定制化信息分析:
 可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容。
 
二、有參考序列物種
標準信息分析:
1. 數據質控、轉錄本分類
2. 轉錄本聚類與校正
3. 與參考基因組比對    
4.進行可變剪切分析
5.新基因預測    
6.融合基因分析    
7.作為參考序列,定量分析    
8.編碼蛋白框預測    
9.lncRNA預測
定制化信息分析 :
可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容





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